目前我國民航局將UAV定位為「有礙飛安物體」，而不是航空器。
我國民航局目前僅許可受軍事、公務機關委託或使用政府經費進行研究、測試、展示或其他形式的UAV作業，學術研究只要是使用公家經費的也視為公用，所以目前國內UAV的空域限制及申請程序只有單一標準。
UAV飛航作業以專案方式申請辦理，再視其作業性能與飛航目的，以專屬空域或協調空域方式實施，除相關民航法規外，尚需遵守國土測繪法、國家機密保護法、要塞堡壘地帶法及國家通訊傳播委員會無線電頻譜之使用規定等，亦針對在機場四周進行UAV作業有需特別注意事項。
UAV空域申請則依據民航局在101年11月26日所發布的AIC 04/2012（無人駕駛航空器系統在台北飛航情報區之作業）來進行審查。由申請單位於作業前15天依制式表格向民航局（航站管理小組）提出申請，主要需提供的資料包括飛航作業日期及時間、空域範圍的經緯度（WGS84）、飛行高度（英尺）、起降地點及其經緯度、作業範圍中心經緯度、最大作業半徑和現場作業人員的聯絡方式等。
除了上述申請作業，還有其他相關限制及規定，例如：非經主管機關准許外，不得進入限航區、人口稠密區及機場管制地帶；作業範圍如涉及軍方空域，並應先行取得軍方單位之許可等。
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